Considerado a última pintura por Raphael, A Transfiguração foi incompleta no momento de sua morte. É geralmente pensado que o aluno de Rafael, Giulio Romano, completou o resto da pintura em 1520. Raphael começou o altar-mor em 1516, que foi encomendado pelo cardeal Giulio de Medici, que mais tarde se tornou o papa Clemente VII. No momento em que foi encomendado, Raphael estava ocupado com muitas outras obras, então de Medici comissionou outro trabalho, The Raising of Lazarus, para fazê-lo trabalhar mais rápido. Após a morte de Rafael, de Medici manteve a pintura, que mais tarde levou as tropas francesas para Paris em 1797. Foi renovado em 1815, no entanto, e tem sido seguro no Vaticano, sua localização atual, desde então.